life系統有哪些測序儀器
① 高通量測序技術ngs用什麼儀器
「普通的基因測序」抄應該是指「常規DNA測序」吧,是用Sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2005年以後,高通量測序就改指第二代測序(Next generation sequencing),454、Solexa(後改為Illumina)和SOLiD等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。
NGS的特點主要有:
1、通量高。一個RUN能產生500Mb-600Gb的數據量。
2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),SOLiD(75-100)。
3、單位數據的成本非常低。現在很多項目測序的費用。已經非常低。生物信息分析成本變得更為重要了。
② 生命科學研究常用的儀器有哪些
垃圾專業
就是試管燒瓶和培養皿
別弄了浪費時間浪費金錢
害人害己
③ 常用的基因測序儀器有哪些生命科學知識在什麼地方可以學習
在生物幫可以找到關於基因測序儀器的介紹,以實驗方法和實驗儀器的改進版為標志DNA測序技術迄今權經歷了三代的發展;常用的五種基因測序儀器ABI 3730XL、ABI SOLID 、Illumina GA、ROCH-454和HeliScope,在那裡有文檔會對儀器進行比較,介紹的比較詳細 有空可以去那兒( YIQI.www.bio1000.com/ )查看一下,在技術文檔中,搜一下就可以找到了。
④ 生物實驗室常用儀器有哪些
顯微鏡
玻片
蓋玻片
膠頭滴管
滴瓶
試管
試管夾
試管架
試管刷
圓底燒瓶
平底燒瓶
廣口瓶
細口瓶
棕色瓶
培養皿
水槽
刀片
鐵架台
鐵盤
儲葯品箱
導管
燒杯
漏斗
分液漏斗
酒精燈
酒精噴燈
電爐
⑤ 生命科學方面近幾年的高端儀器誰知道有哪些
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離心機 天平
超速,高速冷凍,大容量,台式,其他 超微量,分析,精密,其它天平及附件
培養箱/乾燥箱 植物生理生態
CO2/三氣,低溫,植物,生化,雜交,恆溫/恆濕,厭氧,黴菌,烘箱/乾燥箱,其他 植物生理,土壤/生態
同位素/發光檢測 凈化安全消毒
液閃儀,γ計數器,其他同位素,發光檢測 超凈台,生物安全櫃, 消毒/滅菌器,安全防護
顯微系統 轉基因儀
生物,倒置,實體,電子/掃描探針,顯微成像,微操縱,共聚焦,附件及其他/濾波片 轉基因儀
電泳設備 生理/病理/葯理/毒理
電泳儀,電泳槽,國產凝膠成像,進口凝膠成像 電生理儀器,膜片鉗,腦立體定位儀,切片機,動物行為,動物實驗儀器,動物活體成像
檢驗儀器 各類泵
酶標儀,洗板機,微生物,滲透壓,其他檢驗儀器 恆流泵/蠕動泵,注射泵,真空泵及其它泵
PCR 超聲波儀器
普通PCR, 梯度PCR, 定量PCR 清洗,破碎
紫外設備 生物晶元
透射/分析儀,紫外/核酸蛋白檢測儀 生物晶元,點樣儀,掃描儀,晶元分析軟體
光譜/色譜/質譜/層析 樣品處理
光譜/分光光度計,液相,氣相,質譜,氣體發生器 攪拌,勻漿,混合,研磨,均質,搖床/振盪,脫色搖床,移液工作站,核酸提取純化,樣品管理,收集器
低溫/製冷/恆溫 實驗工具耗材
低溫冰箱,液氮容器,凍干機,製冰機,恆溫槽/水浴, 冷卻水循環, 金屬浴,其他溫度設備/程序降溫儀 移液器類,培養類,過濾層析和雜交,試管和離心管,其他實驗耗材
理化分析 試劑
酸度計,離子計/電導計,粒度儀,旋光儀,其它理化分析/SPR 分子生物學,生化,細胞,血清/培養基,免疫/診斷檢測,抗體,神經,標准品/對照品,食品檢測,植物,動物,其他試劑
合成/測序/細胞分析/蛋白質組 實驗動物/細胞株
DNA/有機/多肽合成,測序/基因分析,細胞分析,蛋白質組 實驗動物,動物器具,細胞株/菌種
超濾超純濃縮 實驗室傢具
純水,超濾/微濾,濃縮儀,旋轉蒸發儀 實驗台,通風櫃
發酵罐/細胞反應器 其它
國產發酵罐,進口發酵罐,細胞反應器,發酵罐配套設備 葯檢/制葯,環境監測,食品飲料,圖書,其它
我覺得最貴的那些儀器就是最先進的儀器了。比如個人化操作基因組測序儀
、發現Ion Torrent
Ion Torrent, 個人化操作基因組測序儀(PGM?), 是市場上相較其他測序技術,更簡單,經濟和具有強大的可擴展性的測序平台。PGM?台式系統的設計配合革新性的半導體晶元技術,使整個平台具有極高的擴展性和快速完成測序的性能。
Ion Torrent 技術通過專有的大規模並行半導體感應器,對於DNA 擴增時產生的離子流,實現直接和實時的檢測。當試劑通過集成的流體通路進入Ion Torrent半導體晶元中,密布於晶元上的反應孔立即成為上百萬個微反應體系。這種獨特的流體體系,微體系機械設計和半導體的技術組合,使我們得以快速直接的將遺傳信息翻譯成數碼的DNA測序結果,得到大量高質量的測序數據。
個人化操作基因組測序儀,配合Ion Torrent的半導體晶元,反應試劑盒和計算機伺服器,數據分析套件,提供您最尖端的測序解決方案。
發現『擴展』
比擬半導體技術升級的強大擴展性
? 技術的基礎以超過千億美金規模的半導體產業為支持
? 晶元密度的提升以40年來累積驗證的摩爾定律為證據
? 晶元產量的擴展以四百家標准化半導體生產企業為選擇
發現『簡捷』
簡單真實的生物化學原理
? 真實的離子流測序原理
? 無修飾的核酸,無需酶化學級聯,無需任何熒光和化學發光
? 經濟的標准試劑
發現『快速』
直接,實時的測序技術
? 實現更多的研究和市場應用
? 快速的運行時間提速研究周期和文章的發表
? 革新性的半導體測序晶元,無需光學檢測和掃描
測序和分析流程
Ion Torrent 測序流程標準的要素包括,從准備隨機片段的DNA 文庫或者擴增子文庫,到樣本的PCR 擴增和在PGM?的測序運行。
完成整個PGM?的測序運行後,數據將會自動的導入專用的Torrent 預裝分析套件的計算機伺服器。在這里,原始的測序信號會轉化成鹼基序列並且以工業標準的SFF或者FASTAQ格式存儲起來。這些測序數據可以通過眾多商業化的軟體進行後續不同應用的分析或者全新基因組的拼接。
A. DNA/RNA 樣本
B. 相應的文庫准備
C. 測序樣本准備
D. 測序反應
E. FASTQ 數據格式的測序結果
Torrent 數據分析軟體
Ion Torrent PGM 到 Torrent 伺服器和資料庫 到終端用戶電腦
⑥ 第二代高通量測序都有哪些平台
Illumina公司的Solexa測序平台,目前主流的型號的HiSeq-2500,以及Hiseq-2000,數據通量在每張Flow cell 300G數據,每次最多可以上2張Flow cell,單張Flow cell運行時間大約在11天左右。讀長通常是100BP,據說近期有了長度上的突破。還有一個型號是MiSeq,該機器運行通量較小,但是讀長大約在150BP以上,常用於微生物檢測,而且該型號獲得FDA認證,可以進行臨床樣本的檢測。Solexa的錯誤類型主要是顛換。
羅氏454平台,主要特點是測序長度很長,目前大於1K的測序沒有什麼難度了,比較適合基因組測序,用於搭建基因組框架,也常用於微生物基因組測序。該平台主要的錯誤類型是插入缺失。
ABI的SoLID平台,聽說該平台不在維護了,故而不再描述。
Life的Ion torrent平台,目前主要有2種型號,較早的一個型號是PGM,該測序儀原理類似於454測序,與454不同的是,454是化學反應發光進行檢測,而PGM是半導體測序,檢測H離子,如果發生了鹼基互補配對,那麼高能磷酸鍵就會釋放H離子,導致電位變化,從而根據已知加入的鹼基,就可以判斷待測序列是否與已知加入的鹼基發生互補,從而達到測序目的,測序長度可以達到400BP,主要用於微生物的檢測,錯誤類型也是插入缺失錯誤。最新的型號是IonProton,該機器與PGM測序原理一致,但是測序通量由PGM的1G數據上升至10G數據,測序精度也較PGM有大幅度提升,測序時間大約是1天。
PacBio的單分子三代測序,該測序儀最大的特點就是測序長度比454更長,更加有利於基因組的拼接工作,有些較小的微生物可以直接將基因組測通成環狀。
⑦ 常見二代測序的3種測序方式的共同點有哪些
「普通的基因測序」應該是指「常規DNA測序」吧,是用Sanger法(也就是雙脫氧法)進行測版序的方法,目前非常普權遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2005年以後,高通量測序就改指第二代測序(Next generation sequencing),454、Solexa(後改為Illumina)和SOLiD等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。
NGS的特點主要有:
1、通量高。一個RUN能產生500Mb-600Gb的數據量。
2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),SOLiD(75-100)。
3、單位數據的成本非常低。現在很多項目測序的費用。已經非常低。生物信息分析成本變得更為重要了。
⑧ 生物實驗的基本儀器有哪些
首先要明確生物實驗室有不同的側重和分類,如微生物實驗室、細胞生物學實驗室、分子生物學實驗室、組織培養實驗室等。根據不同的生物實驗室,其常用的儀器也有所不同。
一般來說,微生物實驗室常用儀器有:恆溫培養箱、黴菌培養箱、生化培養箱、超凈工作台、高壓滅菌器、烘箱、加熱板、電爐、電子分析天平、磁力攪拌器、水浴鍋、搖床、離心機、低溫保存箱、移液器、PH計、分光光度計、光學顯微鏡、掃描顯微鏡、均質器等。
分子生物學以及細胞生物學實驗室常用儀器有:二氧化碳培養箱、生物安全櫃、低溫保存箱、烘箱、高壓滅菌器、分析天平、普通天平、移液器、離心機、倒置顯微鏡、PCR儀、電泳儀、脫色搖床等。
組織培養實驗室常用儀器有:高壓滅菌器、烘箱、搖床、光照培養箱、人工氣候培養箱、分析天平、普通天平、超凈工作台等。
而從實驗室工作流程來看,則分為樣品保存、樣品前處理、培養過程、觀察分析等。在不同的工作環節則需要不同的儀器。
一般來說,樣品保存常用儀器有冰箱/超低溫冰箱、液氮罐等。樣品前處理常用儀器有移液器、天平、均質/攪拌系列、離心機、凍干機、高壓滅菌器以及電泳儀等。
在培養過程常用儀器有培養箱系列、生物安全櫃/超凈工作台、發酵罐、搖床、水浴、轉瓶機、PCR儀、酶標儀等。觀察分析時常用儀器有顯微鏡、菌落計數儀、流式細胞儀、DNA測序儀、高效色譜系列等。在生物實驗室中還可能會用到洗瓶機、超純水系列、超聲波清洗機等儀器。
⑨ 基因測序的操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。
總部位於美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出台式基因測序儀Ion Proton,並稱這款產品可在一天時間內完成個人全基因組測序。這意味著基因測序技術有望走進臨床實踐,普通老百姓也能得知自己的基因序列。 但是,這款產品還未獲得FDA(美國食品及葯物管理局)和SFDA(中國國家食品葯品監督管理局)的權威認證,其具體作用還有待檢驗。
總部位於深圳的基因組學研究中心華大基因2013年完成對人類全基因組精準測序的創新領導者Complete Genomics(簡稱「CG」)公司的收購,2015年CG推出一款完全集成式的「超級測序儀」Revolocity™,澳大利亞健康服務公司Mater和荷蘭奈梅亨大學醫學中心成為Revolocity™測序系統的首批用戶。
華大基因擁有Complete Genomics,Illumina HiSeq,ABI SOLiD System,Roche GS FLX Platform,Ion Torrent及Ion Proton等新一代測序平台。其中Complete Genomics測序平台華大基因完全擁有自主知識產權。
⑩ 醫療中生命科學儀器有哪些
離心機 天平
超速,高速冷凍,大容量,台式,其他 超微量,分析,精密,其它天平及附件
培養箱/乾燥箱 植物生理生態
CO2/三氣,低溫,植物,生化,雜交,恆溫/恆濕,厭氧,黴菌,烘箱/乾燥箱,其他 植物生理,土壤/生態
同位素/發光檢測 凈化安全消毒
液閃儀,γ計數器,其他同位素,發光檢測 超凈台,生物安全櫃, 消毒/滅菌器,安全防護
顯微系統 轉基因儀
生物,倒置,實體,電子/掃描探針,顯微成像,微操縱,共聚焦,附件及其他/濾波片 轉基因儀
電泳設備 生理/病理/葯理/毒理
電泳儀,電泳槽,國產凝膠成像,進口凝膠成像 電生理儀器,膜片鉗,腦立體定位儀,切片機,動物行為,動物實驗儀器,動物活體成像
檢驗儀器 各類泵
酶標儀,洗板機,微生物,滲透壓,其他檢驗儀器 恆流泵/蠕動泵,注射泵,真空泵及其它泵
PCR 超聲波儀器
普通PCR, 梯度PCR, 定量PCR 清洗,破碎
紫外設備 生物晶元
透射/分析儀,紫外/核酸蛋白檢測儀 生物晶元,點樣儀,掃描儀,晶元分析軟體
光譜/色譜/質譜/層析 樣品處理
光譜/分光光度計,液相,氣相,質譜,氣體發生器 攪拌,勻漿,混合,研磨,均質,搖床/振盪,脫色搖床,移液工作站,核酸提取純化,樣品管理,收集器
低溫/製冷/恆溫 實驗工具耗材
低溫冰箱,液氮容器,凍干機,製冰機,恆溫槽/水浴, 冷卻水循環, 金屬浴,其他溫度設備/程序降溫儀 移液器類,培養類,過濾層析和雜交,試管和離心管,其他實驗耗材
理化分析 試劑
酸度計,離子計/電導計,粒度儀,旋光儀,其它理化分析/SPR 分子生物學,生化,細胞,血清/培養基,免疫/診斷檢測,抗體,神經,標准品/對照品,食品檢測,植物,動物,其他試劑
合成/測序/細胞分析/蛋白質組 實驗動物/細胞株
DNA/有機/多肽合成,測序/基因分析,細胞分析,蛋白質組 實驗動物,動物器具,細胞株/菌種
超濾超純濃縮 實驗室傢具
純水,超濾/微濾,濃縮儀,旋轉蒸發儀 實驗台,通風櫃
發酵罐/細胞反應器 其它
國產發酵罐,進口發酵罐,細胞反應器,發酵罐配套設備 葯檢/制葯,環境監測,食品飲料,圖書,其它